Neben dem Projektstandort in Berlin-Mitte finden an ausgewählten Grundwassermessstellen regelmäßige Probenahmen statt. Dabei werden ein Jahr lang ca. alle 6 Wochen Grundwasserproben zur Analyse von physikalisch-chemischen Parametern (Temperatur, Sauerstoff, Nitrat, etc.) sowie der DNA des Mikrobioms entnommen. Die Messstellen befinden sich sowohl im dicht bebauten Innenstadtbereich als auch in Stadtrandlagen mit Grünflächen.